Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTK7Q13308 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTK7Q13308 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms