Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CLN3Q13286 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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