Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBX3Q13185 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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