Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN3Q13064 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKRN3Q13064 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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