Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIK2Q13002 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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