Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTP4A2Q12974 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms