Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF2Q12933 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TRAF2Q12933 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF2Q12933 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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