Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN13Q12923 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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