Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HMGXB3Q12766 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HMGXB3Q12766 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HMGXB3Q12766 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms