Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIPAL4Q0D2K0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms