Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD47Q08722 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD47Q08722 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD47Q08722 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD47Q08722 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD47Q08722 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms