Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPOCK1Q08629 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPOCK1Q08629 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms