Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PUDPQ08623 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUDPQ08623 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms