Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4BQ07343 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4BQ07343 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms