Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTDSPL2Q05D32 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms