Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms