Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL6Q02878 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms