Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF8Q02556 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms