Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms