Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IFITM3Q01628 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms