Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DEFA6Q01524 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms