Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A2Q01362 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms