Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE1BQ01064 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE1BQ01064 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms