Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CLTCQ00610 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLTCQ00610 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms