Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT85P78386 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms