Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RPS29P62273 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RPS29P62273 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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