Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVFC1P60507 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVFC1P60507 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms