Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RIPPLY3P57055 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms