Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SUMO3P55854 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms