Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PAX9P55771 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms