Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB4P54760 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB4P54760 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms