Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATN1P54259 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATN1P54259 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATN1P54259 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATN1P54259 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATN1P54259 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATN1P54259 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATN1P54259 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms