Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RND2P52198 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RND2P52198 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RND2P52198 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RND2P52198 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms