Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNA2P51530 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNA2P51530 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNA2P51530 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNA2P51530 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DNA2P51530 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms