Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP4BP51164 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP4BP51164 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms