Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE6CP51160 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE6CP51160 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms