Protein–RNA interactions for Protein: P48050

KCNJ4, Inward rectifier potassium channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ4P48050 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
KCNJ4P48050 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNJ4P48050 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms