Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGER2P43116 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGER2P43116 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms