Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A4P43007 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms