Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL35P42766 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL35P42766 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms