Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPOP42166 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPOP42166 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPOP42166 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPOP42166 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPOP42166 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPOP42166 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms