Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL4P36578 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL4P36578 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms