Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms