Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYLC1P35663 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYLC1P35663 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms