Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP6P35125 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP6P35125 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP6P35125 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP6P35125 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP6P35125 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP6P35125 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP6P35125 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP6P35125 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP6P35125 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP6P35125 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP6P35125 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms