Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFNP31947 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFNP31947 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFNP31947 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFNP31947 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFNP31947 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFNP31947 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms