Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCKSP29966 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms