Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD10P28358 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms