Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB4P28070 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms