Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IL3RAP26951 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms